E2
Taiwan Bioinformatics Institute

 

以 R Shiny 建構互動式蛋白質結構資料庫

 

主辦單位: 國家衛生研究院
國立清華大學生物資訊與結構生物研究所
國科會生技醫藥生物資訊核心設施

簡介:

本課程希望藉由研究蛋白質結構的主題,引導學員如何整合現代生物資訊工具與可視化技術,開發一個交互式的網頁應用,用於存取、瀏覽與分析蛋白質結構數據。透過結合 AlphaFold2 的結構預測能力、R Shiny 的網頁開發框架、DT 的數據表格呈現以及 NGLVieweR 的 3D 分子視覺化功能,學員將學習從資料準備到應用部署的完整流程。RStudio是為R語言設計的一種跨平台整合開發環境,而Shiny是RStudio推出供R語言使用的網頁開發框架,透過Shiny,使用者可以迅速將資料分析結果轉換成互動式的網頁應用。

本課程將涵蓋從基礎知識到實踐操作的全方位內容,幫助學員在理解理論的基礎上,掌握生物資訊工具的應用與實際操作技巧,從而能夠獨立進行蛋白質結構的預測、資料管理和可視化展示。學員亦可藉由本課程的學習,以結構分析的視角切入,實際應用於探討正在研究或是感興趣的蛋白質結構研究。歡迎大家踴躍報名參加!

 

課程資訊:

時間:2025年01月08日(星期三) 09:30-16:30

地點:國立清華大學 生命科學二館R220電腦教室

報名費用:3,000元/每人/三日課程 (與01/0601/07課程一同報名)
                  2,200元/每人/兩日課程
                  1,200元/每人/單日課程

上課人數:35人

 

議程:

2025年1月8日(星期三)
主題:以 R Shiny 建構互動式蛋白質結構資料庫

時間

講員

題目

09:30-10:30

黃柏榕 老師

Alphafold2 and Colabfold

10:30-12:30

黃柏榕 老師

NGLVieweR

13:30-14:30

黃柏榕 老師

R Shiny互動式網頁設計

14:30-16:30

黃柏榕 老師

R Shiny互動式蛋白質結構資料庫設計

  • 黃柏榕 老師 - 長庚大學生物醫學系 副教授

報名方式:

  1. 線上報名:請至活動報名網頁報名,即日起至2024年12月26日或額滿為止。
  2. 線上報名後,請在5日內繳費完畢且在2024年12月26日前完成,完成繳費,方視為報名成功。

 

繳費方式:

  1. 匯款轉帳
    於線上報名後會收到繳費通知與回條說明,請在5日內且在2024年12月26日前轉帳/匯款至
    台新銀行-建北分行(銀行代號:812)
    帳號:004-10-070557-7-00
    戶名:財團法人國家衛生研究院
    轉帳完成後,當天請回覆回條內容。

  2. 若未能於期限前繳費完成者,請事前通知,如逾期未繳視同未報名完成,自動失去報名名額,如有需要請與課程承辦人聯絡。

 

注意事項:

  1. 報名成功者會 E-mail通知上課說明,敬請於報名後5日內且2024年12月26日前繳費完畢;若未能於期限前繳費完成,請事前通知。敬請務必提供正確的E-mail以便寄發報到通知,未收到者請您來電詢問,謝謝!
  2. 繳費完成者如不克參加,恕不退費;發票開立若需抬頭統編請於回條告知,並請妥善留存備查。
  3. 電腦教室不能攜帶飲料進出 (包含食物、飲料)。
  4. 本課程提供午餐。
  5. 全程參與發給上課時數證明。
  6. 如遇額滿情況,可寄信給承辦人預約後補。

 

洽詢方式:

國家衛生研究院 生醫資源中心 齊小姐
電話:(037) 206166 轉 33602
傳真:(037) 586410
E-mail:susanchi@nhri.edu.tw