E2
Taiwan Bioinformatics Institute

 

台灣生物資訊核心設施研習會
 
基因體分析研習會

 

主辦單位:

國家衛生研究院
國立成功大學 分子醫學研究所
國科會生技類核心設施平台維運計畫

簡介:

台灣生物資訊核心設施 (Taiwan Bioinformatics Institute Core Facility, 簡稱 TBI Core Facility)結合了國衛院、清華大學、交通大學以及成功大學四個機構生物資訊中心的專長,提供40餘種免費的分析工具與資料庫的網路服務,並且對學術界提供免費的客製化資料分析服務。

本課程為介紹TBI Core Facility所開發的基因體分析網路工具,包括Repetitive sequence 搜尋、Tumor associate genes搜尋、 DNA binding element搜尋、 病毒演化與監測系統工具、分子親緣關係分析平台、系統生物學與代謝網路建構方法與工具等,搭配電腦實地操作,以簡明的方式讓學員們快速熟悉各種相關資料庫以及研究平台的使用。

這次研習會我們並安排”High throughput genomics data analysis, study design and batch effects”專題演講,希望幫助學員了解high throughput實驗可能的batch effect及處理方法,以避免研究結果因batch effect產生偏誤。

場次:

時間:101 年 7月 19、20 日 (星期四、五)

地點:國立成功大學醫圖電腦教室
台南市北區勝利路138號 [地理位置]

上課人數: 75 人

報名費:免費

議程:

時 間 / 講 員 課 程 內 容
7月19日 (星期四)
09:30 - 10:30
陳嘉興 博士

Introduction to bioinformatics website of genomic medicine researches: NCBI, Emsembl, .....
投影片檔案下載

10:30 - 11:00
陳嘉興 博士

Hands-on practice

11:00 - 11:30
孫孝芳 教授

The gene-based repetitive element database (GBRED)
投影片檔案下載

11:30 - 12:00
孫孝芳 教授

Hands-on practice

Lunch break
13:30 - 14:10
陳嘉興 博士

Tumor associated gene databases: TAG
投影片檔案下載

14:10 - 14:40
陳嘉興 博士

Hands-on practice

14:40 - 15:30
林世杰 博士

The binding elements searching tool: The BEST
投影片檔案下載

15:30 - 16:20
林世杰 博士

Hands-on practice



時 間 / 講 員 課 程 內 容
7月20日 (星期五)
09:30 - 10:10
蘇聖堯 先生

PALM: Phylogenetic Reconstruction by Automatic Likelihood Model Selector
最佳化分子親緣關係分析平台
Hands-on practice
投影片檔案下載

10:20 - 11:00
林介華 女士

POWER: PhylOgenetic WEb Repeater
生物巨分子序列親緣分析流程之整合與最佳化系統
Hands-on practice
投影片檔案下載

11:00 - 12:00
張憶壽 教授

High throughput genomics data analysis, study design and batch effects
投影片檔案下載

Lunch break
13:30-14:00
廖玉潔
助研究員

ATIVS: analytical tool for influenza virus surveillance
病毒演化與監測系統工具介紹
投影片檔案下載

14:10 - 14:30
廖玉潔
助研究員
林信宏 先生

MrBac: A web server for draft metabolic network reconstructions for bacteria
系統生物學與代謝網路建構方法與工具介紹
投影片檔案下載

14:40 - 15:30
廖本揚
助研究員

Phenotype data as an invaluable source for the exploration of biology in the post-genomic era
投影片檔案下載

15:40 - 16:00
翁孟彬 先生

Online Tools for Gene Set Enrichment Analysis on Mutant Phenotypes
投影片檔案下載

 

報名方式及注意事項:

  1. 一律線上報名,報名網頁請見 http://tpmd2.nhri.org.tw/registry/online_sign.php
    101 年 7月 15 日 報名額滿即截止。
    由於座位有限,如報名人數過多,本院保留篩選學員之權利
  2. 上課名單將於課程開始前三天公布於本網頁,同時以 E-mail 通知錄取學員,
    敬請務必提供正確的 E-mail ,謝謝!
  3. 本課程於上午開始 , 請於上課前30分鐘間完成報到。
  4. 本課程恕不供應午餐。
  5. 本課程恕不提供停車服務。
  6. 電腦教室不能攜帶背包與飲料進出 (包含開水,教室外有置物櫃可放)。
  7. 進入醫圖電腦教室 , 需帶證件換證進入。

洽詢方式:

國家衛生研究院 生醫資源中心 齊小姐
電話:(037) 246166 轉 33602
傳真:(037) 586410
E-mail:service@tbi.org.tw
地址:350 苗栗縣竹南鎮科研路 35號