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次世代定序數據分析、
當代生醫研究正快速融合高通量定序與生成式AI技術，為資料分析與視覺化開啟嶄新視角。本次課程將帶領學員深入次世代定序（NGS）資料的處理與詮釋，涵蓋單細胞與空間轉錄體分析實作，並進一步探索生成式AI於生醫領域的應用潛力。課程中將示範如何結合GATK、STAR與Seurat等工具處理複雜基因表現資料，並以ChatGPT、Claude及Google Gemini CLI等AI平台進行資料視覺化與繪圖流程設計。透過多元工具與實例操作，學員將掌握實用技能並建立跨領域分析與圖像化能力。 課程亮點：
課程主題一：次世代定序數據分析 本課程聚焦於當代生醫研究中最具影響力的技術，次世代定序（Next-Generation Sequencing, NGS），涵蓋單細胞與空間轉錄體分析中的應用。課程內容將以口腔癌 WES定序資料為例，從資料的品質控制（Quality Control）、序列比對（Alignment）、變異辨識（Variant Calling）、基因表現定量（Expression Quantification），到統計分析與生物資訊詮釋。 本課程將使用 GATK, STAR, DESeq2, Seurat 等開源工具 (本課程不涉及程式安裝，將預先安裝好供學員使用)。透過實際案例與操作，學員將學習如何整合多樣性的轉錄體資料，並以圖形化方式呈現變異結構、空間表現模式與細胞通訊網絡，使生物醫學資料不僅可解析，更能看得懂。本課程特別強調實作與應用，適合對資料視覺化、轉錄體分析及生醫AI應用有興趣之研究人員與學生。
課程主題二：生成式AI與生醫資料分析視覺化應用 本課程聚焦於如何運用生成式AI技術，協助進行生醫資料分析與視覺化繪圖。內容涵蓋當前熱門的AI概念介紹，包括如 AI代理人（AI Agent）、模型上下文協定（Model Context Protocol），以及提升知識檢索效率的 RAG（Retrieval-Augmented Generation）介紹。 課程在上機操作部分，將帶領學員實際操作 ChatGPT、Claude等線上生成式AI平台，進行人機協作數據繪圖，再搭配Google Colab程式開發平台，學習如何透過自然語言指令，在不透過程式撰寫下，產出資料摘要與科學圖表。我們也將一步一步帶領學員安裝 Google Gemini CLI 代理人環境，詳細說明如何設定 Gemini 命令列工具，並透過 CLI 搭配 Python 等語言，建立專屬的 AI 數據前處理與繪圖代理人，實現個人化、可控的資料視覺化應用流程。無論您是初次接觸AI，或已具備資料分析經驗，都能透過本課程掌握生成式AI於生醫資料處理的實務技巧，並強化資料視覺化呈現與自動化分析的能力。
2025年8月5日(星期二) 長庚大學
2025年8月6日(星期三) 長庚大學 / 2025年8月27日(星期三) 慈濟大學
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簡介：
