E2
Taiwan Bioinformatics Institute

 

生物資訊應用於蛋白質藥物開發實作

 

主辦單位: 國家衛生研究院
國立清華大學生物資訊與結構生物研究所
長庚大學分子醫學研究中心
國科會生技醫藥生物資訊核心設施
協辦單位: 清華大學教育部精準健康產業跨領域人才培育計畫

簡介:

想要深入了解蛋白質結構及其應用嗎?我們的課程將帶您從基礎開始,探索蛋白質結構的奧秘,並實際應用於蛋白質與藥物的結合研究。

課程內容包括:

  • 結構視覺化與具象化:使用3D結構視覺化軟體(PyMOL),讓您快速掌握與呈現蛋白質結構的基礎特性,展現Ligand與蛋白質間的氫鍵配對狀況,了解如何處理與儲存結構檔案,同時也銜接後續分子對接結構的前處理。
  • AlphaFold結構模擬實作:靈活運用傳統的SWISS-MODEL和目前準確度最高的AlphaFold2 & 3結構模擬,銜接後續蛋白質結構實驗設計。
  • 藥物設計與對接:基於藥物設計概念,實際演練蛋白質與藥物分子對接(Molecular docking)和虛擬藥物篩選,以及蛋白質與蛋白質之間的對接。
  • 分子作用力分析:深入分析蛋白質與藥物分子或其他蛋白質之間的分子作用力。
  • 實際操作與經驗分享:通過實例和經驗分享,讓您快速了解與掌握結構生物資訊分析工具的功能和技巧。

我們的課程從研究蛋白質結構的角度切入,以結構視覺化和具象化的方式,帶領大家觀察與操作蛋白質結構,學習結構模擬,了解蛋白質與藥物的結合,並實際應用於相關的結構研究。這些研究模式同樣也適合想要了解如何應用結構生物資訊探討自己實驗標的蛋白質的研究者,可以藉由結構分析的視角切入與輔助解釋現有的實驗結果。歡迎大家踴躍報名參加!

 

課程資訊:

時間:2025年02月13日(星期四) ~ 02月14日(星期五)

地點:國立清華大學 第二綜合大樓計算機中心2樓 電腦教室III

報名費用:2,000元/每人/兩日課程、1,200元/每人/單日課程

上課人數:35人

 

議程:

2025年02月13日(星期四)
主題:蛋白質結構視覺化軟體操作與AlphaFold結構模擬

時間

講員

題目

09:30-10:30

劉益忠 博士

1. Introduction to Protein Structure Analysis
蛋白質結構生物資訊應用與介紹

10:30-12:30

劉益忠 博士

2. Protein Structure Visualization (PyMOL)
蛋白質結構視覺化軟體實作

13:30-14:30

劉益忠 博士

3. Introduction to Structure Modeling and Molecular Docking
蛋白質結構模擬與分子對接介紹

14:30-16:30

劉益忠 博士

4. Protein Structure Prediction with AlphaFold2 & AlphaFold3
AlphaFold2 & AlphaFold3結構預測實作

2025年02月14日(星期五)
主題:蛋白質-藥物分子對接、蛋白質-蛋白質對接與其分子作用力分析

時間

講員

題目

09:30-11:30

劉益忠 博士

1. Molecular Docking and Virtual Screening
蛋白質-藥物分子對接與虛擬篩選實作

11:30-12:30

劉益忠 博士

2. Protein-ligand Interaction
蛋白質與藥物分子間分子作用力分析

13:30-15:30

劉益忠 博士

3. Protein-protein Docking
蛋白質-蛋白質對接實作

15:30-16:30

劉益忠 博士

4. Protein-protein Interaction
蛋白質與蛋白質間分子作用力分析

  • 劉益忠 - 國家衛生研究院 群體健康科學研究所 博士後研究員

報名方式:

  1. 線上報名:請至活動報名網頁報名,即日起至2025年02月05日或額滿為止。
  2. 線上報名後,請在5日內繳費完畢且在2025年02月05日前完成,完成繳費,方視為報名成功。

 

繳費方式:

  1. 匯款轉帳
    於線上報名後會收到繳費通知與回條說明,請在5日內且在2025年02月05日前轉帳/匯款至
    台新銀行-建北分行(銀行代號:812)
    帳號:004-10-070557-7-00
    戶名:財團法人國家衛生研究院
    轉帳完成後,當天請回覆回條內容。

  2. 若未能於期限前繳費完成者,請事前通知,如逾期未繳視同未報名完成,自動失去報名名額,如有需要請與課程承辦人聯絡。

 

注意事項:

  1. 報名成功者會 E-mail通知上課說明,敬請於報名後5日內且2025年02月05日前繳費完畢;若未能於期限前繳費完成,請事前通知。敬請務必提供正確的E-mail以便寄發報到通知,未收到者請您來電詢問,謝謝!
  2. 繳費完成者如不克參加,恕不退費;發票開立若需抬頭統編請於回條告知,並請妥善留存備查。
  3. 電腦教室不能攜帶飲料進出 (包含食物、飲料)。
  4. 本課程提供午餐。
  5. 全程參與發給上課時數證明。
  6. 如遇額滿情況,可寄信給承辦人預約後補。

 

洽詢方式:

國家衛生研究院 生醫資源中心 齊小姐
電話:(037) 206166 轉 33602
傳真:(037) 586410
E-mail:susanchi@nhri.edu.tw