高通量資料分析研習會:單細胞RNA定序數據分析系列課程(一)
簡介:
本系列研習會旨在研討如何利用高通量數據(high-throughput data)所提供之特殊機會,來提高生物醫學實驗之真實性(validity)與再現性(reproducibility),並促進各相關領域的合作。在各種高通量數據產生之技術平台中,單細胞RNA定序(single-cell RNA sequencing)技術近來發展趨於成熟的重要技術,已經在腫瘤學、免疫學、以及發育生物學的各研究領域逐漸被大量應用。 有鑒於此,此次課程將簡介此技術之基本原理與資料產生流程,以及現有商用平台及開放平台可用以分析的套裝軟體,並將著重於資料品質控制之議題,適合對單細胞技術應用與其資料分析有興趣者參加。參加實作課程學員須具備使用R套件之基本知識。
場次:
時間:2021 年 4月 8日 (星期四)
地點:講座 國家衛生研究院 第三會議室 實作 國家衛生研究院 圖資大樓5樓電腦教室
上課人數:講座 100 人 ; 實作 20 人
報名費:講座 500 元; 實作 500 元
議程
時間
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講員
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題目
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9:00-9:20
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江士昇 博士
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單細胞RNA定序技術演進與現行平台簡介
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9:20-10:10
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翁子洋 博士
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BD Rhapsody Single-Cell Analysis System 單細胞分析系統與SeqGeq資料分析平台介紹
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10:20-11:10
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林孟儒 女士
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Partek single-cell RNAseq資料分析pipeline介紹
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11:10-11:30
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黎彥良 博士
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經驗分享:Single-cell analysis reveals immune modulation and metabolic switch in tumor-draining lymph nodes
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11:30-12:00
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陳中興 博士
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單細胞RNA定序資料分析簡介
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13:30-15:30
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蔡芳榆 女士 陳中興 博士
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單細胞RNA定序資料分析軟體簡介與實作 R package: Seurat, Doubletfinder
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15:30-16:30
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蔡芳榆 女士 陳中興 博士
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Gene set variation analysis (GSVA) 簡介
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- 江士昇 國家衛生研究院 癌症研究所 助研究員
- 翁子洋 騰達行企業股份有限公司 Field Application Scientist
- 林孟儒 均泰生物科技股份有限公司 生物資訊部主任
- 黎彥良 高雄醫學大學藥學系/ 國家衛生研究院癌症研究所 洪文俊教授研究室 博士後學者
- 陳中興 國家衛生研究院 癌症研究所 助研究員
- 蔡芳榆 國家衛生研究院 癌症研究所 研究助理
報名方式:
- 線上報名:請至活動報名網頁報名,即日起至2021年4月1日或額滿為止。
- 線上報名後,請在5日內繳費完畢且在2021年4月1日前完成,完成繳費,方視為報名成功。
繳費方式:
- 匯款轉帳
於線上報名後會收到繳費通知與回條說明,請在5日內且在2021年4月1日前轉帳/匯款至
台新銀行-建北分行(銀行代號:812)
帳號:004-10-070557-7-00
戶名:財團法人國家衛生研究院
轉帳完成後,當天請回覆回條內容。
- 若未能於期限前繳費完成者,請事前通知,如逾期未繳視同未報名完成,自動失去報名名額,如有需要請與課程承辦人聯絡。
注意事項:
- 報名成功者會 E-mail通知上課說明,敬請於2021年4月1日前繳費完畢;若未能於期限前繳費完成,請事前通知。敬請務必提供正確的E-mail以便寄發報到通知,報名完當日未收到者請您來電詢問,謝謝!
- 繳費完成者如不克參加,恕不退費;發票開立若需抬頭統編請於回條告知,並請妥善留存備查。
- 本課程請全程配戴口罩上課, 並於上課前10分鐘間完成報到。
- 電腦教室不能攜帶飲料進出 (包含食物、飲料)。
- 全程參與發給上課時數證明。
- 如遇額滿情況,可寄信給承辦人預約後補。
- 報名後5日內且在2021年4月1日前完成繳費完畢。
洽詢方式:
國家衛生研究院 生醫資源中心 齊小姐
電話:(037) 206166 轉 33602
傳真:(037) 586410
E-mail:susanchi@nhri.edu.tw
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