基因體醫學生技研發生物資訊核心設施
GMBD Core Services Workshop
結 構 生 物 資 訊 學 研 習 會
主辦單位: |
國家衛生研究院 |
基因體醫學國家型科技計畫 |
簡介:
結構生物資訊學著重於蛋白質基本概念、蛋白質功能,以及蛋白質之結構特性。課程中對於蛋白質一級結構(序列)、二級結構和三級結構的特徵、形成、功能等,都將依序介紹;另一方面,藉由結構檢視軟體,可以模擬並觀察蛋白質的三度立體空間中、具有哪些特別的構造,以及重要胺基酸的排列方式。因此,從蛋白質的結構之中,我們將能更進一步的釐清其在生理上扮演角色、具備的功能,以及代謝上的生化機制。總而言之,結構生物資訊學不僅僅是蛋白質體學中重要的一環,對於基因體學以及系統生物學而言,它也屬於重要的入門知識之一。
課程中也將介紹世界上重要的蛋白質研究相關資料庫或工具網站;並教導如何操作 3D結構檢視軟體Rasmol與PyMOL;我們更搭配 GMBD Core Service Website 中自行研發之蛋白質體學相關之分析工具,藉此輔助蛋白質功能上和結構上的進階研究,俾使學員們對於結構生物資訊學有更深一層的認識。
本研習會搭配電腦實習操作,以簡明的方式讓學員們熟悉各種資料庫以及分析工具的使用,並達到 GMBD Core 對國內研究人員提供生物資訊合作支援的目標。
課程內容:
時間:100 年 4月 26-27 日 (星期二、星期三)
地點:資策會資訊技術訓練中心(台北中心)
台北市大安區復興南路一段 390號 2樓 [交通資訊] [地圖]上課人數: 共計 40人;
講員:國立清華大學生物資訊與結構生物研究所 呂平江 教授
國立清華大學生物資訊與結構生物研究所 李季青 先生
國立交通大學生物資訊及系統生物研究所 陳志杰 先生
國立交通大學生物資訊及系統生物研究所 顏士中 先生
國立交通大學生物資訊及系統生物研究所 許凱程 先生
國立交通大學生物資訊及系統生物研究所 許勝達 先生
報名費:免費
議程:
時 間 / 講 員 | 課 程 內 容 |
4月26日 (星期二) | |
09:30 - 12:00 呂平江 教授 |
Introduction to sequence
and structural analysis: BLAST, Gene Prediction,
ClustalW, Protein Data Bank |
Lunch break | |
13:30 - 14:30 呂平江 教授 |
Protein structure visualization:
Rasmol |
14:30 - 15:30 呂平江 教授 |
Structure comparison: SARST,
CPSARST, iSARST |
15:30 - 16:30 李季青 先生 |
Genome profile database:
GPDB |
4月27日 (星期四) | |
09:30 - 10:30 陳志杰 先生 |
Structure prediction and homology modeling: (PS)2 |
10:30 - 12:00 顏士中 先生 |
Tools for viewing protein structure:
PyMOL |
Lunch break | |
13:30 - 14:30 許凱程 先生 |
Structure-based drug design |
14:30 - 16:00 許勝達 先生 |
Databases and tools for microRNA research |
報名方式及注意事項:
- 一律線上報名,報名網頁請見 http://registry.nhri.org.tw/apply_form.asp。
100 年 4月 22 日 或報名額滿即截止。由於座位有限,如報名人數過多,本院保留篩選學員之權利。 - 上課名單將於課程開始前三天公布於本網頁,同時以 E-mail 通知錄取學員, 敬請務必提供正確的 E-mail ,謝謝!
- 本課程恕不供應午餐。
洽詢方式:
國家衛生研究院 生醫資源中心
電話:(037) 206166 轉 33621
傳真:(037) 586410
E-mail:service@tbi.org.tw
地址:350苗栗縣竹南鎮科研路35號