|
基因體醫學及生技研發之生物資訊核心設施
基因體註解與轉錄調控分析研習會
 簡介：
在生物體中，基因表現往往是經由一連串複雜的調控機制來完成，而細胞核內的轉錄調控(transcriptional regulation) 和mRNA合成調控 (mRNA processing
control)，更扮演了很重要的角色。為了普及基因體註解及轉錄調控之分析工具使用，本研習會將介紹 NCBI、Ensembl、UCSC、UniProt 等重要的生物醫學網路資源之使用操作，這些網路資源除了可以幫助我們尋找基因和序列外，還有許多其他功能也會一一說明。另一方面，本課程也將特別介紹與
transcriptional regulation 有關的網路工具與資料庫，例如：TRANSFAC、JASPAR、TESS等。課程的進行會針對幾個實驗室常見的問題做講解與說明，如：
如何對大量未知序列做基因註解
如何快速尋找 homologous genes 的 genomic DNA、mRNA和 protein sequences？並同時做序列比對與演化樹分析?
要怎麼知道基因的 GC content、基因上游是否有CpG islands？
如何尋找與下載 microarray data？下載回來的資料要怎麼看？
如何知道蛋白質上有甚麼 domain？以及有甚麼蛋白質會與我有興趣的蛋白質有 interaction？
要如何知道蛋白質有沒有post-translational modification？
要如何找 transcription start sites (TSSs)與 transcription factor binding sites(TFBSs)?
如何找尋 co-expressed gene promoters 上共同的motif？
課程同時透過電腦上機的實際操作，讓與會學員充分練習並熟悉相關的分析。
課程內容：
時間：100 年 4月 22 日 (星期五)
地點：國家衛生研究院圖資大樓 5樓電腦教室
苗栗縣竹南鎮科研路 35 號 [交通路線圖]
上課人數： 40 人 (本教室有20個電腦座位，另有20個座位歡迎自行攜帶筆電上課)
報名費：免費
講 員 ：成功大學熱帶植物研究所 張文綺助理教授
議程：
|
時 間
|
課 程 內 容
|
|
4月22日 (星期五)
|
| 09:20 - 10:00 |
Registration 學員報到
|
| 10:00 -12:30 |
Browsing Genomes: NCBI Genome Browser, Taxonomy, UCSC Genome Browser, and Ensembl
|
|
Lunch break
|
| 13:30 - 15:30 |
Transcriptional Regulation: cis-regulatory Elements Prediction, and DNA Motif Discovery
|
| 15:30 - 16:00 |
Hand-on practice
|
報名方式及注意事項：
-
一律線上報名，報名網頁請見 http://tpmd2.nhri.org.tw/registry/online_sign.php。
100 年 4月 17 日 或 報名額滿即截止。
由於座位有限，如報名人數過多，本院保留篩選學員之權利。
-
上課名單將於課程開始前三天公布於本網頁，同時以 E-mail 通知錄取學員，
敬請務必提供正確的 E-mail ，謝謝！
-
本課程於上午 10:00 開始 ， 請於早上 9:20- 10:00 間完成報到，以免影響上課秩序。
-
本課程恕不供應午餐。
洽詢方式：
國家衛生研究院 生醫資源中心
電話：(037) 206166 轉 33621
傳真：(037) 586410
E-mail：service@tbi.org.tw
地址：350 苗栗縣竹南鎮科研路 35號
|
