|
基因體醫學及生技研發之生物資訊核心設施
Phylogenetic Analysis Workshop
親 緣 演 化 分 析 研 習 會
 簡介：
「親緣演化分析」係利用序列分析以鑑別物種起源，推測基因及基因體演化歷史的方法，近年來更廣泛應用於病毒流行病學，如愛滋病毒、肝炎病毒及流感病毒方面的研究。為普及親緣演化分析工具之使用，「基因體醫學及生技研發之生物資訊核心設施」特開設親緣演化分析研習課程，除介紹親緣演化分析的基本理論、建構演化樹之方法，以及不同之樹型圖所代表的意義外，並配合常用之親緣演化分析工具：如Phylip, Treeview, Tree Puzzle, Mega, SimPlot,
Split tree, POWER, Palm 等軟體的實際操作，俾使學員對演化分析能有更進一步的了解，並合適的應用於個人之學術研究之中。
課程內容：
時間：100 年 3月 21-22 日 (星期一、星期二)
地點：國立成功大學資訊大樓2樓 75209 電腦教室
台南市大學路1號 [地理位置] [電腦教室]
上課人數： 50 人
報名費：免費
講 員 ：劉信孚 博士，馬偕紀念醫院 醫學研究部 副研究員
議程：
|
時 間
|
課 程 內 容
|
|
3月21日 (星期一)
|
| 08:30 - 09:30 |
學 員 報 到
|
09:30 - 10:30
劉信孚 博士 |
Introduction to Molecular Evolution and Phylogenetic Analysis
|
10:30 - 12:00
劉信孚 博士 |
Phylogenetic Analysis Methods
Nucleotide substitution models
Distance matrix methods
|
|
Lunch break
|
13:30 - 15:30
劉信孚 博士 |
Computer Lab
Phylip home page, BioEdit, Mega, clustalX, Genedoc
Phylogenetic analysis programs (PHYLIP): distance matrix methods
|
15:30 - 16:30
劉信孚 博士 |
Phylogenetic Analysis Methods
Discrete character methods (Maximum parsimony)
Computer Lab
PHYLIP: Maximum parsimony
|
|
3月22日 (星期二)
|
09:30 - 12:00
劉信孚 博士 |
Phylogenetic Analysis Methods
Maximum likelihood method
Statistical Test for Phylogenetic Trees
Bootstrap analysis
Computer Lab
PHYLIP: ML, Seqboot
|
| Lunch break |
13:30 - 15:00
劉信孚 博士 |
The Other Phylogenetic Analysis Methods
Quartet puzzling method: Likelihood mapping analysis
Bayesian analyses
Split decomposition method
|
15:00 - 16:30
劉信孚 博士 |
Detecting Recombination in Viral Sequences
Similarity plot, bootscan plot
Computer Lab
Simplot, Splits tree
Examples of Applications Using Phylogenetic Analysis
|
16:30-17:00
|
POWER (Phylogenetic Web Repeater)
Power: Graphical interface of PHYLIP programs
http://power.nhri.org.tw/
Hands on Practice
|
報名方式及注意事項：
-
一律線上報名，報名網頁請見 http://registry.nhri.org.tw/apply_form.asp。
100 年 3月 15 日 或 報名額滿即截止。
由於座位有限，如報名人數過多，本院保留篩選學員之權利。
-
上課名單將於課程開始前三天公布於本網頁，同時以 E-mail 通知錄取學員，
敬請務必提供正確的 E-mail ，謝謝！
-
本課程於上午 9:30 開始 ， 請於早上 9:00- 9:30 間完成報到，以免影響上課秩序。
-
本課程恕不供應午餐。
-
本課程恕不提供停車服務。
洽詢方式：
國家衛生研究院 生醫資源中心
電話：(037) 206166 轉 33621
傳真：(037) 586410
E-mail：service@tbi.org.tw
地址：350 苗栗縣竹南鎮科研路 35號
|
