E2
Taiwan Bioinformatics Institute

基因體醫學生技研發生物資訊核心

JEMBOSS 基 礎 課 程

 

主辦單位：

國家衛生研究院
中央研究院生命科學圖書館
基因體醫學國家型科技計畫

簡介：

TBI 基因體醫學生技研發生物資訊核心為基因體醫學國家型科技計畫所支持，由國家衛生研究院生醫資訊服務組執行，以提供並推廣各項生物資訊服務為宗旨。為普及 JEMBOSS 分析工具的使用，本計畫特與中央研究院生命科學圖書館合作，開設JEMBOSS基礎課程。JEMBOSS 全名為 Java-EMBOSS，即 Java 介面的 EMBOSS 程式圖形使用介面，為英國的 HGMP-RC (Human Genome Mapping Program Resource Centre) 所開發之軟體，採用user-friendly 的 Java 視窗執行 EMBOSS 程式，並加入檔案管理功能，使用者於下載並且安裝 Java we start 程式後， 即可在自己的 PC 上操作 JEMBOSS，進行序列分析工作並儲存結果，使用相當方便。本課程內容將概括介紹生物資訊網路資源、序列資料庫、以及 JEMBOSS 分析工具之原理和操作方法，並透過電腦實作範例的方式，讓使用者能在課程結束後順利使用 JEMBOSS 進行序列分析的工作。本課程為最基礎之課程，適合序列分析初學者報名參加 。

課程內容：

時間：96 年 11月 21-22 日 (星期三、星期四)

地點：中研院生命科學圖書館電腦教室
　　　台北市南港區研究院路二段 128 號　 [地圖]

上課人數： 50人

報名費：免費

講 員 ：國家衛生研究院 生醫資訊服務組 李桂玉 主任、、王旭川 女士

議程：

時 　 間
內 　　　容
96 年 11 月21日
(星期三)

09:30 - 16:30
  • 課程簡介(李桂玉)
  • JEMBOSS系統簡介及基本操作 (汪詩海)
  • 資料庫及 EMBOSS 程式簡介：wossname, seqret (汪詩海)
  • 以文字搜尋資料庫Entrez, ExPASy, EBI (李桂玉)
  • 序列比對分析基本概念 (李桂玉)
  • 資料庫搜尋比對BLAST (王旭川)
  • JEMBOSS序列分析程式簡介 needle, water, emma, showalign, prettyplot (王旭川)
  • JEMBOSS序列分析程式簡介remap, getorf, plotorf (汪詩海)
    • 96 年 11 月22日
    (星期四)

    09:30 - 12:00
  • JEMBOSS引子預測程式 primer3 (王旭川)
  • JEMBOSS蛋白質特性分析程式 pepstats, charge, hmoment, pepwheel (王旭川)
  • JEMBOSS蛋白質pattern搜尋：patmatmotifs, fuzzpro (汪詩海)
  • EMBOSS GUI 介紹 (汪詩海)

    •  

    報名方式及注意事項：

    1. 一律線上報名，報名網頁請見 http://registry.nhri.org.tw/apply_form.asp。
      96 年 11 月 16 日 或報名額滿即截止。由於座位有限，如報名人數過多，
      本院保留篩選學員之權利。
    2. 上課名單將於課程開始前三天公布於本網頁，同時以 E-mail 通知錄取學員，
      敬請務必提供正確的 E-mail ，謝謝！
    3. 中研院生圖於早上 8:40 開館 ， 請於早上 9:30 前完成報到程序，以免影響上課秩序。
    4. 本課程恕不供應午餐。

     

    洽詢方式：

    國家衛生研究院 生醫資源中心　
     電話：(037) 206166 轉 33621
     傳真：(037) 586410
     E-mail：service@tbi.org.tw
    地址：350苗栗縣竹南鎮科研路35號