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國家衛生研究院 EMBOSS 服務
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EMBOSS 簡介 | ||||||||||||||||||||||||||||||
| EMBOSS 全名為 European Molecular Biology Open Software Suite，是免費公開的序列分析用程式組，由分子生物研究社群所共同開發，其程式與世界蛋白質、核酸資料庫連結，並同步更新，除可用來搜尋序列、進行序列比對、尋找蛋白質motif、domain、二級結構等分析外，EMBOSS程式碼完全公開，且其核心程式基本設計為與各種開發平台相容，可以供研究人員作為開發應用程式的平台，世界各不同機構也因此開發了各種EMBOSS使用介面，目前國衛院安裝的是常用的JEMBOSS, unix command mode EMBOSS,以及Luke's EMBOSS GUI。 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| 一、JEMBOSS | |||||||||||||||||||||||||||||||
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JEMBOSS 全名為 Java-EMBOSS，即 Java 介面的 EMBOSS 程式圖形使用介面，為英國的 HGMP-RC (Human Genome Mapping Program Resource Centre) 所開發並持續維護更新，但目前已轉移給Sourceforge.net 負責維護。它採用 user-friendly 的 Java 視窗執行 EMBOSS 程式，並加入檔案管理功能，使用者 download Java 執行程式後，即可在自己的 PC 執行 emboss 程式並儲存分析結果，使用方便。 |
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| 二、Command Mode EMBOSS | |||||||||||||||||||||||||||||||
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在 Unix 系統執行 EMBOSS，對熟悉Unix指令的是用者而言，程式執行十分快速。其核心程式亦由英國的 Sourceforge.net 負責維護。 |
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| 三、EMBOSS GUI | |||||||||||||||||||||||||||||||
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由 Luke McCarthy (Plant Biotechnology Institute, National Research Council of Canada, (http://bioinfo.pbi.nrc.ca/) 所開發出來的網路介面，並且持續維護更新，將常用的EMBOSS程式整理分類，撰寫簡潔的網路介面 ，供使用者以網路瀏覽器操作 EMBOSS程式，很受學界歡迎。原站位於 http://www.cbr.nrc.ca/EMBOSS 。 |
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