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線上課程：基因表現數據分析軟體教育訓練
 簡介：
Partek Flow是一套用於NGS高通量大數據分析的商用軟體，架構在強大的運算主機上提供服務，具有簡易圖形化操作介面，可輕鬆建立個人化分析流程(pipeline)，輔助研究者快速解析資料呈現結果，更可利用軟體輕鬆繪製PCA, t-SNE, Heatmap, Volcano Plot等直觀圖呈現實驗結果，讓基因體學的研究者們無需藉由程式語言也能完成數據分析。
本次教育訓練將介紹基因表現數據分析的原理與應用，搭配商用軟體Demo sample實機操作，用簡明的方式引導學員使用Partek Flow軟體之RNA sequencing data analysis與Single Cell RNA expression data analysis，期望讓生物背景研究者自己也能操作軟體完成統計分析與圖表，不再望資料而興嘆，歡迎有興趣的研究學者踴躍參加。
各場次課程說明
RNA sequencing data analysis：次世代定序所產生龐大的資料量，在資料分析時常造成生物背景的研究者的困境。藉由商用分析軟體的協助，帶領各位學員實機操作學習RNA-Seq數據分析流程與其使用之方法，分析完成後再利用軟體輕鬆繪製PCA, Heatmap, Venn diagrams…等多種常用圖形。
Single Cell RNA expression data analysis：隨著科技與定序技術推進，許多應用上都有所突破，單細胞定序及數據分析開始扮演重要的角色。我們可藉由商用分析軟體的協助，透過Single Cell RNA expression分析可了解多樣品之特定基因在不同細胞中的RNA表現量，並觀察特定細胞群中基因表現量的差異，目前已成為NGS應用之主要趨勢。新增Clonotype Frequency Plot繪圖功能，只要匯入Annotation CSV files，即可在不同免疫組庫之間量化比較clone多樣性。
課程資訊：
時間：2022年11月22日(星期二) 09:10-16:00
地點：以Cisco Webex軟體進行線上電腦實作 ※實作過程中如遇雲端伺服器流量限制，為不影響課程進度，將優先以講師Demo為主。
報名費用：1,500元 (包含全日線上實作課程及課後教學影片一個月觀看期)
上課人數：50人(如額滿請來信候補，釋出空缺後將依序通知)※全程參與者將核發電子研習證書
議程:
RNA expression data analysis
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時間
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講員
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題目
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09:10 ~ 09:20
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孫孝芳 教授
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Opening
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09:30 ~ 10:00
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邱暄雅 專員
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Partek Flow Introduction
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10:00 ~ 12:00
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邱暄雅 專員
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Bulk RNA-seq analysis hands-on
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Single Cell RNA expression data analysis
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時間
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講員
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題目
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13:30 ~ 16:00
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邱暄雅 專員
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Single cell RNA-seq analysis hands-on
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- 孫孝芳 國立成功大學分子醫學研究所 教授
- 邱暄雅 均泰生物科技股份有限公司 生物資訊分析專員
報名方式：
- 線上報名：請至活動報名網頁報名，即日起至2022年11月17日或額滿為止。
- 線上報名後，請在5日內繳費完畢且在2022年11月17日前完成，完成繳費，方視為報名成功。
繳費方式：
- 匯款轉帳
於線上報名後會收到繳費通知與回條說明，請在5日內且在2022年11月17日前轉帳/匯款至
台新銀行-建北分行（銀行代號：812）
帳號：００４－１０－０７０５５７－７－００
戶名：財團法人國家衛生研究院
轉帳完成後，當天請回覆回條內容。
- 若未能於期限前繳費完成者，請事前通知，如逾期未繳視同未報名完成，自動失去報名名額，如有需要請與課程承辦人聯絡。
注意事項：
- 本次課程內容著作權屬於作者，請遵守著作財產權法規，未經同意不得重製、利用或散佈。
- 報名成功者會 E-mail通知上課說明，敬請於2022年11月17日前繳費完畢；若未能於期限前繳費完成，請事前通知。敬請務必提供正確的E-mail以便寄發報到通知，未收到者請您來電詢問，謝謝！
- 敬請務必提供正確的E-mail以便寄發線上課程連線資訊，上課前2日未仍收到者請您來電詢問，謝謝！
- 繳費完成者如不克參加，恕不退費；發票開立若需抬頭統編請於回條告知，並請妥善留存備查。
- 建議您事前下載Webex視訊軟體，並建議使用電腦連線。
- 如遇額滿情況，可寄信給承辦人預約候補。
洽詢方式：
國家衛生研究院 生醫資源中心 齊小姐
電話：(037) 206166 轉 33602
傳真：(037) 586410
E-mail：susanchi@nhri.edu.tw
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