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Taiwan Bioinformatics Institute

 

高通量資料分析研習會:單細胞RNA定序數據分析系列課程(一)

 

主辦單位:

國家衛生研究院癌症研究所
國家衛生研究院群體健康科學研究所
科技部生技醫藥生物資訊核心設施

協辦單位:

騰達行企業股份有限公司
均泰生物科技股份有限公司

簡介:

本系列研習會旨在研討如何利用高通量數據(high-throughput data)所提供之特殊機會,來提高生物醫學實驗之真實性(validity)與再現性(reproducibility),並促進各相關領域的合作。在各種高通量數據產生之技術平台中,單細胞RNA定序(single-cell RNA sequencing)技術近來發展趨於成熟的重要技術,已經在腫瘤學、免疫學、以及發育生物學的各研究領域逐漸被大量應用。 有鑒於此,此次課程將簡介此技術之基本原理與資料產生流程,以及現有商用平台及開放平台可用以分析的套裝軟體,並將著重於資料品質控制之議題,適合對單細胞技術應用與其資料分析有興趣者參加。參加實作課程學員須具備使用R套件之基本知識。

 

場次:

時間:2021 年 4月 8日 (星期四)

地點:講座 國家衛生研究院 第三會議室
           實作 國家衛生研究院 圖資大樓5樓電腦教室

上課人數:講座 100 人 ; 實作 20 人

報名費:講座 500 元; 實作 500 元

議程

時間

講員

題目

9:00-9:20

江士昇 博士

單細胞RNA定序技術演進與現行平台簡介

9:20-10:10

翁子洋 博士

BD Rhapsody Single-Cell Analysis System 單細胞分析系統與SeqGeq資料分析平台介紹

10:20-11:10

林孟儒 女士

Partek single-cell RNAseq資料分析pipeline介紹

11:10-11:30

黎彥良 博士

經驗分享:Single-cell analysis reveals immune modulation and metabolic switch in tumor-draining lymph nodes

11:30-12:00

陳中興 博士

單細胞RNA定序資料分析簡介

13:30-15:30

蔡芳榆 女士
陳中興 博士

單細胞RNA定序資料分析軟體簡介與實作
R package: Seurat, Doubletfinder

15:30-16:30

蔡芳榆 女士
陳中興 博士

Gene set variation analysis (GSVA) 簡介

  • 江士昇 國家衛生研究院 癌症研究所 助研究員
  • 翁子洋 騰達行企業股份有限公司 Field Application Scientist
  • 林孟儒 均泰生物科技股份有限公司 生物資訊部主任
  • 黎彥良 高雄醫學大學藥學系/ 國家衛生研究院癌症研究所 洪文俊教授研究室 博士後學者
  • 陳中興 國家衛生研究院 癌症研究所 助研究員
  • 蔡芳榆 國家衛生研究院 癌症研究所 研究助理

報名方式:

  1. 線上報名:請至活動報名網頁報名,即日起至2021年4月1日或額滿為止。
  2. 線上報名後,請在5日內繳費完畢且在2021年4月1日前完成,完成繳費,方視為報名成功。

 

繳費方式:

  1. 匯款轉帳
    於線上報名後會收到繳費通知與回條說明,請在5日內且在2021年4月1日前轉帳/匯款至
    台新銀行-建北分行(銀行代號:812)
    帳號:004-10-070557-7-00
    戶名:財團法人國家衛生研究院
    轉帳完成後,當天請回覆回條內容。

  2. 若未能於期限前繳費完成者,請事前通知,如逾期未繳視同未報名完成,自動失去報名名額,如有需要請與課程承辦人聯絡。

 

注意事項:

  1. 報名成功者會 E-mail通知上課說明,敬請於2021年4月1日前繳費完畢;若未能於期限前繳費完成,請事前通知。敬請務必提供正確的E-mail以便寄發報到通知,報名完當日未收到者請您來電詢問,謝謝!
  2. 繳費完成者如不克參加,恕不退費;發票開立若需抬頭統編請於回條告知,並請妥善留存備查。
  3. 本課程請全程配戴口罩上課, 並於上課前10分鐘間完成報到。
  4. 電腦教室不能攜帶飲料進出 (包含食物、飲料)。
  5. 全程參與發給上課時數證明。
  6. 如遇額滿情況,可寄信給承辦人預約後補。
  7. 報名後5日內且在2021年4月1日前完成繳費完畢。

 

洽詢方式:

國家衛生研究院 生醫資源中心 齊小姐
電話:(037) 206166 轉 33602
傳真:(037) 586410
E-mail:susanchi@nhri.edu.tw

 

 
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