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Taiwan Bioinformatics Institute

 

小分子結構分析在新藥開發之應用研習會【新竹場、台南場】

 

主辦單位:

國家衛生研究院
國立成功大學分子醫學研究所
科技部生技醫藥核心設施平台

協辦單位:

國立成功大學基因體醫學中心

簡介:

為便利各地學者能就近參與生物資訊分析實務課程,生技醫藥生物資訊核心設施計畫將於台南成功大學與新竹清華大學各舉辦一場研習會,內容完全相同。此次研習會課程內容以Discovery Studio(DS)為依據,內容包含基礎理論、實際應用到進階實機操作分析。使用者除了熟習軟體功能及應用層面外,更能透過實機練習進一步學會處理各種小分子之理論模擬計算、分子Structure /ligand-based的策略和操作,並以分子結構為基礎之交互作用性預測功能(包含Docking, Pharmacophore等方法)。

利用結構生物學尋找分子及細胞標靶是目前在新藥開發領域廣泛被應用的分析技術平台。針對應用於蛋白質模擬、標靶藥物研究,結構藥物…等軟體工具的需求日益增加,美商BIOVIA公司開發了專業性研究軟體Discovery Studio(DS)。DS的主要功能包括有:

  1. 比較蛋白質間之序列,並根據序列的相似程度,推測蛋白質之功能。
  2. 建構和修改核酸、蛋白質以及多胜肽之結構,可計算分子表面之靜電力場和溶媒能
  3. 根據同源蛋白質之3D結構,自動、快速地進行目標蛋白質結構之模組。
  4. 藉由同源蛋白之序列與結構訊息,了解目標蛋白質之功能與分類,並進一步製做樹狀圖,進行物種演化之分析。
  5. 透過CHARMm進行古典力學與分子動力學之計算,研究大、小分子的能量與變化性。CHARMm可與DS之其它模組搭配,完成各種模擬計算,例如:蛋白質、小藥物對接程式CDOCKER。
  6. 利用小片段資料庫,配合蛋白質結構資訊,設計新的藥物或對已存在之藥物進行結構改造,篩選出具有潛力之藥物小分子後再進行合成。
  7. 可將小藥物分子與受體的活性口袋進行對接,了解對接位向。搭配小分子資料庫與平行化計算技術,可進行藥物結合可能性之高速篩選(Virtual High-Throughput Screening)。
  8. 預測小藥物分子的吸收、分佈、代謝路徑、分泌以及毒性。
  9. 預測蛋白和蛋白結合位向。

期望經此課程能對從事「蛋白質、化學分子、藥物設計」等相關領域之研究人員及學生,在實驗上之解釋或設計的幫助和方向,歡迎有興趣的師生踴躍參加。

 

場次:

時間:107年3月14日(星期三)【台南成大場】
           107年3月22日(星期四)【新竹清大場】

地點:國立成功大學 計算機中心二樓209電腦教室 【台南成大場】
           國立清華大學 生命科學二館 R220電腦教室【新竹清大場】

上課人數:50人 【台南成大場】
                  40人 【新竹清大場】

報名費:1,000元【台南成大場】
              1,000元【新竹清大場】

 

議程 107年3月14日(三) 【台南成大場】 / 3月22日(四)【新竹清大場】

時間

講員

題目

09:00 ~ 10:00

孫孝芳 老師

研究實例
小分子藥物篩選在抗癌新藥研發上的應用

10:00 ~ 12:00

陳冠文 資深副理

Introduction to Predictive Science
‧ Challenges of the Life Science Industry
‧ Small Molecules Solution
Hands-on實機操作教學

13:00 ~ 14:30

陳冠文 資深副理

Discovery Studio: Receptor-Ligand Interactions
小分子化合物接合模擬
Hands-on 實機操作教學

14:40 ~ 17:00

陳冠文 資深副理

Find the Uniqueness: Small-Molecule Design
小分子化合物與資料庫設計
Hands-on 實機操作教學

  • 孫孝芳 - 國立成功大學分子醫學研究所 所長兼教授
  • 陳冠文 - 創源生物科技股份有限公司 資深副理

報名方式:

  1. 線上報名:請至活動報名網頁報名,即日起至107年3月5日或額滿為止。
  2. 線上報名後,請於03月05日前完成繳費,方視為報名成功

 

繳費方式:

  1. 匯款轉帳
    於線上報名後,請在,請在107年03月05日前帳匯款至
    台新銀行-建北分行(銀行代號:812)
    帳號:004-10-070557-7-00
    戶名:財團法人國家衛生研究院
    轉帳完成後,當天請傳真或e-mail通知承辦人員確認,並提供以下資料:
    (1) 學員姓名及連絡電話(手機為佳)。
    (2) 匯款單影本。
    (3) 發票抬頭及統一編號,如無需要則請註明,發票將於課程當天領取。

  2. 若未能於期限前繳費完成者,請事前通知,如逾期未繳視同未報名完成。

 

注意事項

  1. 報名成功者會 E-mail通知上課說明,敬請於107年3月5日前繳費完畢;若未能於期限前繳費完成,請事前通知。敬請務必提供正確的E-mail以便寄發報到通知,未收到者請您來電詢問,謝謝!
  2. 繳費完成者如不克參加,恕不退費;發票開立若需抬頭統編請事先告知,並請妥善留存備查,恕不更改或補發。
  3. 請於上課前10分鐘間完成報到。
  4. 電腦教室不能攜帶飲料進出 (包含食物及開水、飲料)。
  5. 本課程恕不提供停車服務。
  6. 全程參與者核發證書。

 

洽詢方式:

國家衛生研究院 生醫資源中心 齊小姐
電話:(037) 246166 轉 33602
傳真:(037) 586410
E-mail:susanchi@nhri.org.tw