E2
Taiwan Bioinformatics Institute

 

大(小)分子結構分析在新藥開發之應用研習會

 

主辦單位:

國家衛生研究院
國立成功大學分子醫學研究所
科技部生技類核心設施平台維運計畫

協辦單位:

國立成功大學基因體醫學中心

簡介:

利用結構生物學尋找分子及細胞標靶是目前在新藥開發領域廣泛被應用的分析技術平台。針對應用於蛋白質模擬、標靶藥物研究,結構藥物…等設計軟體工具的需求日益增加,美商BIOVIA公司開發了專業性研究軟體Discovery Studio(DS)。DS的主要功能包括有:

  1. 比較蛋白質間之序列,並根據序列的相似程度,推測蛋白質之功能。
  2. 建構和修改核酸、蛋白質以及多胜肽之結構,可計算分子表面之靜電力場和溶媒能
  3. 根據同源蛋白質之3D結構,自動、快速地進行目標蛋白質結構之模組。
  4. 藉由同源蛋白之序列與結構訊息,了解目標蛋白質之功能與分類,並進一步製做樹狀圖,進行物種演化之分析。
  5. 透過CHARMm進行古典力學與分子動力學之計算,研究大、小分子的能量與變化性。CHARMm可與DS之其它模組搭配,完成各種模擬計算,例如:蛋白質、小藥物對接程式CDOCKER。
  6. 利用小片段資料庫,配合蛋白質結構資訊,設計新的藥物或對已存在之藥物進行結構改造,篩選出具有潛力之藥物小分子後再進行合成。
  7. 可將小藥物分子與受體的活性口袋進行對接,了解對接位向。搭配小分子資料庫與平行化計算技術,可進行藥物結合可能性之高速篩選(Virtual High-Throughput Screening)。
  8. 預測小藥物分子的吸收、分佈、代謝路徑、分泌以及毒性。
  9. 預測蛋白和蛋白結合位向。

本課程內容包含基礎理論、實際應用到進階實機操作。先利用實際研究成果作經驗分享,讓使用者了解其軟體功能及應用層面。進一步透過實機練習讓使用者學會處理各種大、小分子之理論模擬計算、分子Structure-/ligand-based的策略和操作,並以分子結構為基礎之交互作用性預測功能(包含Docking, Pharmacophore等方法)。期望經此課程能對從事「蛋白質、化學分子、藥物設計」等相關領域之研究人員及學生,提供在實驗上之解釋或設計的幫助和方向。

場次:

時間:105 年 7月 11 日 (星期一) ~ 7月 12 日 (星期二)

地點:成功大學成功校區資訊大樓(計算機中心)2樓209電腦教室

上課人數: 40人

報名費:105年7月11日 1000元、105年7月12日 1000元

105年7月11日 議程

時間

講員

題目

09:00 ~ 09:50

陳譽文 博士

研究實例
小分子藥物篩選在抗癌新藥研發上的應用

10:00 ~ 12:00

陳冠文 副理

Introduction to Predictive Science
~ Challenges of the Life Science Industry
~ Small Molecules Solution
Hands-on 基本介面操作教學 (實機演練)

13:00 ~ 14:20

陳冠文 副理

Discovery Studio: Receptor-Ligand Interactions
小分子化合物接合模擬
Hands-on 基本介面操作教學 (實機演練)

14:30 ~ 17:00

陳冠文 副理

Find the Uniqueness: Small-Molecule Design
小分子化合物與資料庫設計
Hands-on 基本介面操作教學 (實機演練)

105年7月12日 議程

時間

講員

題目

09:00 ~ 09:50

楊士德 老師

研究實例
電腦輔助分子藥物及蛋白質藥物的篩選

10:00 ~ 12:00

陳冠文 副理

Introduction to Predictive Science
~ Challenges of the Life Science Industry
~ Biologics Solution
Hands-on 基本介面操作教學 (實機演練)

13:00 ~ 17:00

陳冠文 副理

Differentiate Your Product: Protein-Protein Interactions & Protein Design
蛋白質接合模擬與蛋白質結構設計
Hands-on 基本介面操作教學 (實機演練)

  • 陳譽文 國家衛生研究院 博士後研究員
  • 楊士德 成功大學資訊工程學系暨研究所 助理教授
  • 陳冠文 創源生物科技股份有限公司 副理

報名方式:

  1. 線上報名:請至活動報名網頁報名,即日起至105年7月3日或額滿為止。
  2. 線上報名後,請於105年7月4日前完成繳費,方視為報名成功

 

繳費方式:

  1. 匯款轉帳
    於線上報名後,請在 105年7月4日前轉帳匯款至
    台新銀行-建北分行(銀行代號:812)
    帳號:004-10-070557-7-00
    戶名:財團法人國家衛生研究院
    轉帳完成後,當天請傳真或e-mail通知承辦人員確認,並提供以下資料:

    (1) 學員姓名及連絡電話(手機為佳)。

    (2) 匯款單影本。

    (3) 發票抬頭及統一編號,如無需要則請註明,發票將於課程當天領取。

  2. 若未能於期限前繳費完成者,請事前通知,如逾期未繳視同未報名完成。

 

注意事項

  1. 報名成功者會 E-mail通知上課說明,敬請於105年7月4日前繳費完畢;若未能於期限前繳費完成,請事前通知。敬請務必提供正確的E-mail以便寄發報到通知,未收到者請您來電詢問,謝謝!
  2. 繳費完成者如不克參加,恕不退費;發票開立若需抬頭統編請事先告知,並請妥善留存備查,恕不更改或補發。
  3. 請於上課前10分鐘間完成報到。
  4. 電腦教室不能攜帶飲料進出 (包含食物及開水、飲料)。
  5. 本課程恕不提供停車服務。
  6. 全程參與者核發證書。

 

洽詢方式:

國家衛生研究院 生醫資源中心 齊小姐
電話:(037) 246166 轉 33602
傳真:(037) 586410
E-mail:susanchi@nhri.org.tw

 

 
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