E2
Taiwan Bioinformatics Institute

 

台灣生物資訊核心設施研習會

 

主辦單位：

國家衛生研究院
國立清華大學生物資訊與結構生物研究所
國科會生技類核心設施平台維運計畫

簡介：

台灣生物資訊核心設施 (Taiwan Bioinformatics Institute Core Facility, 簡稱 TBI Core Facility)結合了國衛院、清華大學、交通大學以及成功大學四個機構生物資訊中心的專長，提供40餘種分析工具與資料庫的線上服務，並且對學術界提供免費的客製化資料分析服務。

本課程分三場介紹TBI Core Facility所開發的分析工具與分析方法，包括結構生物資訊分析工具、高通量資料分析方法、應用生物資訊方法分析microRNA的調控與功能、miRNA分析工具與資料庫、分子親緣關係分析平台、全基因體代謝網路建構方法與工具等，搭配電腦實地操作，以簡明的方式讓學員們快速熟悉分析方法以及分析工具的使用。

場次（一）：

時間：102 年 6月 26 日 (星期三)

地點：國立清華大學生命科學二館R220電腦教室
            新竹市光復路二段101號　[地理位置]

上課人數： 36 人

報名費：免費

主題：結構生物資訊學研習會

時 間 / 講 員 課 程 內 容
09:30 - 11:00
呂平江 教授

Databases for Protein Structure
蛋白質結構資料庫及相關分析工具介紹
講義下載[PDF]  [On-line Video]

11:00 - 12:00
呂平江 教授

Protein Structure Modeling & Pediction: SwissModel, PS2
蛋白質結構模擬與預測：SwissModel, PS2
講義下載[PDF]  [On-line Video]

Lunch break
13:30 - 15:00
羅惟正
助理教授

Structural comparison: CE, iSARST, CPDB
利用結構比對方法搜尋相近的蛋白質：CE, iSARST, CPDB
講義下載[PDF]  [On-line Video]

15:00 - 16:30
劉益忠 博士

Protein structure visualization: PyMOL
結構視覺化軟體操作：PyMOL
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場次（二）：

時間：102 年 6月 27 日 (星期四)

地點：國立清華大學生命科學二館R220電腦教室
            新竹市光復路二段101號　[地理位置]

上課人數： 36 人

報名費：免費

主題：高通量資料分析研習會

時 間 / 講 員 課 程 內 容
09:30 - 10:30
陳中興 博士

Dealing with Batch Effects with High-Throughput Genomic Data
講義下載[PDF]  [On-line Video]

10:30 - 12:00
江士昇
助研究員

Pathway Analysis Based on High-throughput Genomic Data
講義下載[PDF]  [On-line Video]

Lunch break
13:30 - 14:30
陳中興 博士

Removing Batch Effects in Gene Expression Array Study:實例操作
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14:30 - 16:30
江士昇
助研究員

GSEA: Gene Set Enrichment Analysis軟體操作
檔案下載[RAR]  [On-line Video]

場次（三）：

時間：102 年 6月 28 日 (星期五)

地點：國立清華大學生命科學二館R220電腦教室
            新竹市光復路二段101號　[地理位置]

上課人數： 36 人

報名費：免費

主題：基因體分析研習會

時 間 / 講 員 課 程 內 容
09:30 - 10:30
黃憲達 教授

Bioinformatics Analysis of microRNA Regulation and Function.
應用生物資訊方法分析microRNA的調控與功能
講義下載[PDF]  [On-line Video]

10:30 - 12:00
許勝達 博士
周致宏 先生

Bioinformatics Resources for microRNAs: Tools, Databases, and Platforms
Micro RNA分析工具與資料庫
講義下載[PDF]  [On-line Video]

Lunch break
13:30 - 14:30
蘇聖堯 先生

PALM: Phylogenetic Reconstruction by Automatic Likelihood Model Selector
最佳化分子親緣關係分析平台介紹與練習
講義下載[PDF]  [On-line Video]

14:30 - 16:00
廖玉潔
助研究員

GEMSiRV: A software platform for GEnome-scale Metabolic models Simulation, Reconstruction and Visualization
全基因規模的代謝網路建構、模擬與視覺化平台之介紹與實際操作
講義下載[PDF]

 

報名方式及注意事項：

  1. 三場課程分開報名，並一律線上報名，報名網頁請見 http://tpmd2.nhri.org.tw/registry/online_sign.php。
    102 年 6月 22 日 或 報名額滿即截止。
    由於座位有限，如報名人數過多，本院保留篩選學員之權利。
  2. 上課名單將於課程開始前三天公布於本網頁，同時以 E-mail 通知，
    敬請務必提供正確的 E-mail ，謝謝！
  3. 本課程於上午開始 ， 請於上課前30分鐘間完成報到。
  4. 本課程恕不提供停車服務。
  5. 電腦教室不能攜帶飲料進出。
  6. 本課程提供午餐。

洽詢方式：

國家衛生研究院 生醫資源中心　齊小姐
 電話：(037) 206166 轉 33602
 傳真：(037) 586410
 E-mail：susanchi@nhri.org.tw
地址：350 苗栗縣竹南鎮科研路 35號