E2
Taiwan Bioinformatics Institute

基因體醫學生技研發生物資訊核心設施

GMBD Core Services Workshop
結 構 生 物 資 訊 學 研 習 會

主辦單位:

國家衛生研究院
基因體醫學國家型科技計畫

簡介:

  

結構生物資訊學著重於蛋白質基本概念、蛋白質功能,以及蛋白質之結構特性。課程中對於蛋白質一級結構(序列)、二級結構和三級結構的特徵、形成、功能等,都將依序介紹;另一方面,藉由結構檢視軟體,可以模擬並觀察蛋白質的三度立體空間中、具有哪些特別的構造,以及重要胺基酸的排列方式。因此,從蛋白質的結構之中,我們將能更進一步的釐清其在生理上扮演角色、具備的功能,以及代謝上的生化機制。總而言之,結構生物資訊學不僅僅是蛋白質體學中重要的一環,對於基因體學以及系統生物學而言,它也屬於重要的入門知識之一。

課程中也將介紹世界上重要的蛋白質研究相關資料庫或工具網站;並教導如何操作 3D結構檢視軟體Rasmol與PyMOL;我們更搭配 GMBD Core Service Website 中自行研發之蛋白質體學相關之分析工具,藉此輔助蛋白質功能上和結構上的進階研究,俾使學員們對於結構生物資訊學有更深一層的認識。

本研習會搭配電腦實習操作,以簡明的方式讓學員們熟悉各種資料庫以及分析工具的使用,並達到 GMBD Core 對國內研究人員提供生物資訊合作支援的目標。

課程內容:

時間:100 年 4月 26-27 日 (星期二、星期三)

地點:資策會資訊技術訓練中心(台北中心)
台北市大安區復興南路一段 390號 2樓 [交通資訊] [地圖]

上課人數: 共計 40人;

講員:國立清華大學生物資訊與結構生物研究所 呂平江 教授
國立清華大學生物資訊與結構生物研究所 李季青 先生
國立交通大學生物資訊及系統生物研究所 陳志杰 先生
國立交通大學生物資訊及系統生物研究所 顏士中 先生
國立交通大學生物資訊及系統生物研究所 許凱程 先生
國立交通大學生物資訊及系統生物研究所 許勝達 先生

報名費:免費

議程:

時 間 / 講 員 課 程 內 容
4月26日 (星期二)
09:30 - 12:00
呂平江 教授

Introduction to sequence and structural analysis: BLAST, Gene Prediction, ClustalW, Protein Data Bank
蛋白質序列分析、結構分析及相關分析工具介紹

Lunch break
13:30 - 14:30
呂平江 教授

Protein structure visualization: Rasmol
結構檢視軟體操作 (一):Rasmol

14:30 - 15:30
呂平江 教授

Structure comparison: SARST, CPSARST, iSARST
利用結構比對方法搜尋相近的蛋白質:SARST, CPSARST, iSARST

15:30 - 16:30
李季青 先生

Genome profile database: GPDB
蛋白質體學分析工具:GPDB

4月27日 (星期四)
09:30 - 10:30
陳志杰 先生

Structure prediction and homology modeling: (PS)2
蛋白質結構預測工具:(PS)2

10:30 - 12:00
顏士中 先生

Tools for viewing protein structure: PyMOL
結構檢視軟體操作 (二):PyMOL

Lunch break
13:30 - 14:30
許凱程 先生

Structure-based drug design
利用蛋白質結構進行藥物設計

14:30 - 16:00
許勝達 先生

Databases and tools for microRNA research
microRNA研究之工具介紹

 

報名方式及注意事項:

  1. 一律線上報名,報名網頁請見 http://registry.nhri.org.tw/apply_form.asp
    100 年 4月 22 日 或報名額滿即截止。由於座位有限,如報名人數過多,本院保留篩選學員之權利。
  2. 上課名單將於課程開始前三天公布於本網頁,同時以 E-mail 通知錄取學員, 敬請務必提供正確的 E-mail ,謝謝!
  3. 本課程恕不供應午餐。

 

洽詢方式:

國家衛生研究院 生醫資源中心 
電話:(037) 246166 轉 33621
傳真:(037) 586410
E-mail:service@tbi.org.tw
地址:350苗栗縣竹南鎮科研路35號