E2
Taiwan Bioinformatics Institute

基因體醫學生技研發生物資訊核心設施

GMBD Core Services Workshop
基 因 體 分 析 工 具 研 習 會

主辦單位:

國家衛生研究院
高雄醫學大學
基因體醫學國家型科技計畫

簡介:

  本課程將講解基因體醫學與系統生物學基礎背景知識及常用資料庫,並介紹「基因體醫學及生技研發之生物資訊核心設施 (簡稱 GMBD Core)」所開發的分析工具,包括Primer設計、蛋白質交互作用分析、分子演化分析、SNP資料庫、Tumor associated genes 分析,以及 DNA binding element 搜尋等,各項工具的解說均配有電腦操作,使學員可以迅速熟悉工具的使用,進而有助於研究工作的順利進行,達到 GMBD Core 對研究人員提供生物資訊支援的目標。

  本研習將搭配電腦實地操作與線上影片教學,將以簡明的方式讓學員們快速熟悉各種相關資料庫以及研究平台的使用。

課程內容:

時間:99年 6月 21-22 日 (星期一、星期二)

地點:高雄醫學大學濟世大樓 CS217 電腦教室
   高雄市三民區十全一路 100 號  [地圖] [交通資訊 (PDF file)]

上課人數: 70人

講員:成功大學分子醫學研究所 孫孝芳 教授、陳嘉興 博士、林世杰 先生
   中央研究院資訊科學研究所 林仲彥 助研究員、蘇聖堯 先生
   國家衛生研究院 林介華 女士、唐月霞 女士

報名費:免費

議程:

時 間 / 講 員 課 程 內 容
6月21日 (星期一)
09:30 - 10:30
陳嘉興 博士

Introduction to bioinformatics website of genomic medicine researches: NCBI, Emsembl, .....

10:30 - 11:00
陳嘉興 博士

Hands-on practice

11:00 - 11:30
孫孝芳 教授

The NCKU value-added SNP database: VA-SNP

11:30 - 12:00
孫孝芳 教授

Hands-on practice

Lunch break
13:30 - 14:20
陳嘉興 博士

Tumor associated gene databases: TAG

14:20 - 14:50
陳嘉興 博士

Hands-on practice

14:50 - 15:30
林世杰 先生

The binding elements searching tool: The BEST

15:30 - 16:00
林世杰 先生

Hands-on practice

6月22日 (星期二)
09:30 - 10:30
林仲彥 助研究員

Introduction of comparative genomics and interactomes with related bioinformatics resources: Essential skills for Bioinformatics, Introduction on myBLAST (web version, standalone), AfterGenbank, ELN (Electronic Lab Notebook)

10:30 - 11:00
林仲彥 助研究員
唐月霞 女士

Hands-on practice

11:00 - 11:30
林仲彥 助研究員

Transcriptomics: Primers and microarray probe design tools in high throughput experiments: PDA , UPS

11:30 - 12:00
林仲彥 助研究員
唐月霞 女士

Hands-on practice

Lunch break
13:30-14:00
林仲彥 助研究員

Interactomics: From protein to network, protein-protein interactions databases: hp-DPI , Fly-DPI

14:00-14:30
林仲彥 助研究員

Systems Biology : The interaction network analyzer: HUBBA, cytoHubba

14:30 - 15:00
林仲彥 助研究員

Hands-on practice

15:00 - 15:30
蘇聖堯 先生

Phylogenetics: Reconstruction of evolutionary relationship, POWER, PALM

15:30 - 16:00
蘇聖堯 先生

Hands-on practice

 

報名方式及注意事項:

  1. 一律線上報名,報名網頁請見 http://registry.nhri.org.tw/apply_form.asp
    99 年 6月 13 日 或報名額滿即截止。由於座位有限,如報名人數過多, 本院保留篩選學員之權利。
  2. 上課名單將於課程開始前五天公布於本網頁,同時以 E-mail 通知錄取學員, 敬請務必提供正確的 E-mail ,謝謝!
  3. 本課程恕不供應午餐。

 

洽詢方式:

國家衛生研究院 生醫資源中心 
電話:(037) 246166 轉 33621
傳真:(037) 586410
E-mail:service@tbi.org.tw
地址:350苗栗縣竹南鎮科研路35號