E2
Taiwan Bioinformatics Institute

基因體醫學生技研發生物資訊核心

Phylogenetic Analysis Workshop
分子演化分析研習會

 

主辦單位:

國家衛生研究院
基因體醫學國家型科技計畫

簡介:

「分子演化分析」係利用序列分析以鑑別物種起源,推測基因及基因體演化歷史的方法,近年來更廣泛應用於病毒流行病學,特別是愛滋病毒方面的研究。為普及分子演化分析工具之使用,基因體醫學生技研發生物資訊核心特開設分子演化分析研習課程,介紹分子演化分析基本理論、建構演化樹之方法,以及不同演化樹所代表的意義,並配合常用之分子演化分析軟體的實際操作,俾使學員對分子演化分析能有更進一步的了解。

課程內容:

時間:96年 10月 16-17日 (星期二、星期三)

地點:中研院生圖電腦教室
   北市研究院路二段 128 號 [地圖]

上課人數: 50 人

報名費:免費

講 員 :劉信孚 博士,馬偕紀念醫院 醫學研究部 副研究員

     林仲彥 博士,中央研究院 資訊科學研究所 助研究員

議程:

時   間 課 程 內 容
10月16日 (星期二)
09:30 - 10:40
劉信孚 博士

Introduction to Molecular Evolution and Phylogenetic Analysis
Molecular evolution
Phylogenetic trees
Theoretical background of different phylogenetic methods

10:50 - 12:00

Phylogenetic Analysis Methods
Distance matrix methods; Nucleotide substitution models

Lunch break
13:30 - 15:00
劉信孚 博士

Computer Lab
Phylip home page, Genedoc (file conversion), BioEdit, Mega
Phylogenetic analysis programs (PHYLIP): distance matrix methods

15:15 - 16:30
劉信孚 博士

Phylogenetic Analysis Methods
Discrete character methods (Maximum parsimony method)
Computer Lab
PHYLIP: Parsimony

10月17日 (星期三)
9:30 - 10:40
劉信孚 博士

Phylogenetic Analysis Methods
Discrete character methods (Maximum likelihood method)

Statistical Test for Phylogenetic Trees
Bootstrap analysis

Computer Lab
PHYLIP: ML, Seqboot

10:50 - 12:00
劉信孚 博士

Examples of Applications Using Phylogenetic Analysis

The Other Phylogenetic Analysis Methods
Quartet puzzling method, Likelihood mapping analysis

Lunch break
13:30 - 15:20
劉信孚 博士

Detecting Recombination in Viral Sequences
Simplot

Computer Lab
TREE-PUZZLE, Simplot,
Free practice and trouble shooting.

15:30-16:30
林仲彥 博士

POWER (Phylogenetic Web Repeater)
Power: Graphical interface of PHYLIP programs

 

報名方式及注意事項:

    1. 一律線上報名,報名網頁請見 http://registry.nhri.org.tw/apply_form.asp
      96 年 10月 08日 或報名額滿即截止。由於座位有限,如報名人數過多,
      本院保留篩選學員之權利。
    2. 上課名單將於課程開始前三天公布於本網頁,同時以 E-mail 通知錄取學員,
      敬請務必提供正確的 E-mail ,謝謝!
    3. 本課程於上午 9:30 開始 , 請於早上 9:00- 9:30間完成報到,以免影響上課秩序。
    4. 本課程恕不供應午餐。

洽詢方式:

國家衛生研究院 生醫資源中心 
電話:(037) 246166 轉 33621
傳真:(037) 586410
E-mail:service@tbi.org.tw
地址:350 苗栗縣竹南鎮科研路 35號