E2
Taiwan Bioinformatics Institute

基因體醫學生技研發生物資訊核心

JEMBOSS 基 礎 課 程

 

主辦單位:

國家衛生研究院
中央研究院
基因體醫學國家型科技計畫

簡介:

TBI基因體醫學生技研發生物資訊核心為基因體醫學國家型科技計畫所支持,由國家衛生研究院研究資源處執行,以提供並推廣各項生物資訊服務為宗旨。為普及JEMBOSS分析工具的使用,特於國家衛生研究院研究資源週活動,開設JEMBOSS基礎課程。JEMBOSS全名為Java-EMBOSS,即Java介面的EMBOSS程式圖形使用介面,為英國的HGMP-RC(Human Genome Mapping Program Resource Centre)所開發並持續維護更新,採用user-friendly的Java視窗執行EMBOSS程式,並加入檔案管理功能,使用者download Java we start執行程式後,即可在自己的PC操作JEMBOSS並儲存分析結果,使用方便。本課程將介紹網路資源、常用JEMBOSS軟體之原理和使用方法介紹,並提供電腦實作,讓使用者能更在課程結束後順利使用JEMBOSS進行序列分析的工作。本課程為最基礎之課程,適合初學序列分析者

 

課程內容:

時間:95年 9月 20-21日 (星期三、四)

地點:中研院生命科學圖書館電腦教室
   台北市南港區研究院路二段 128 號  [地圖]

上課人數: 40人

報名費:免費

講 員 :國家衛生研究院 生醫資訊服務組 李桂玉 主任、、王旭川 女士

議程:

時   間
內    容
95 年 9 月20-21日
(星期三、四)

09:30 - 16:30

  • 課程簡介(李桂玉)
  • JEMBOSS系統簡介及基本操作 (汪詩海)
  • 資料庫及 EMBOSS 程式簡介:wossname, seqret (汪詩海)
  • 以文字搜尋資料庫Entrez, ExPASy, EBI (李桂玉)
  • 資料庫搜尋比對BLAST (李桂玉)
  • 序列比對分析基本概念 (李桂玉)
  • JEMBOSS序列分析程式簡介 needle, water, emma, showalign, prettyplot (李桂玉)
  • JEMBOSS序列分析程式簡介remap, getorf, plotorf (王旭川)
  • JEMBOSS引子預測程式 primer3 (王旭川)
  • JEMBOSS蛋白質特性分析程式 pepstats, charge, hmoment, pepwheel (王旭川)
  • JEMBOSS蛋白質pattern搜尋:patmatmotifs, fuzzpro (汪詩海)
  • EMBOSS GUI 介紹 (汪詩海)

學員名單:

姓 名
單  位
職 稱
丁貞勻
中央研究院
研究助理
王妙鈴
農委會畜產試驗所
研究助理
吳姿璉
林口長庚醫院
研究助理
林杰良
台大醫學院
博士後研究
邱俊棠
中國醫藥研究所
助理研究員
施鈺瑩
中央研究院
博士生
孫俊仁
三軍總醫院
醫檢師
翁嘉偉
南台科技大學
學生
崔道貞
台大醫院
醫檢師
張淑貞
農委會農業試驗所
助理研究員
莊淑錚
台北教育大學
研究生
郭祖祥
中研院生醫所
研究生
陳天文
中央研究院
研究助理
陳志煉
台中市動物防疫所
技士
陳彥文
疾病管制局
研究助理
陳彥宏
中原大學
學生
游韻真
中山大學
研究生
黃欽敬
中央研究院
博士生
楊景富
大葉大學
研究助理
溫明達
台北附醫
住院醫師
葉曉倩
中山大學
博士生
劉家宏
中央研究院
研究助理
劉晉明
長庚大學
研究生
蔡坤憲
疾病管制局
博士後研究
鄭畹蓁
東海大學
學生
魯懿萍
家畜疾病防治所
技士
藍羚元
陽明大學
研究助理
羅彥俐
國家衛生研究院
博士後研究
蘇敬堯
中央研究院
博士生

 

報名方式及注意事項:

  1. 本課程以 E-mail 發給學員上課通知,報名資格請勿轉讓或代理參加。
  2. 請準時於早上 9:00-9:30 報到,報到時將發給上課證供進出圖書館之用,請先出示上課證,待館員開門後進入。注意勿逕用手推閘門,以免閘門損壞
  3. 上課時可自行帶 DNA 序列做為練習之用,請以 "純文字格式" 存在磁碟片隨身碟中。
  4. 上課時請勿攜帶太多物品,並請遵守上課場所的相關規定。
  5. 本課程恕不供應午餐
  6. 本課程遵守中研院規定,自行開車者,停車費用請參考中研院網頁說明

洽詢方式:

國家衛生研究院 生醫資源中心 
電話:(037) 246166 轉 33621
傳真:(037) 586410
E-mail:service@tbi.org.tw
地址:350苗栗縣竹南鎮科研路35號