E2
Taiwan Bioinformatics Institute

基因體醫學生技研發生物資訊核心

JEMBOSS 基 礎 課 程

 

主辦單位:

國家衛生研究院
中國醫藥大學
基因體醫學國家型科技計畫

簡介:

TBI基因體醫學生技研發生物資訊核心為基因體醫學國家型科技計畫所支持,由國家衛生研究院研究資源處執行,以提供並推廣各項生物資訊服務為宗旨。為普及JEMBOSS分析工具的使用,本計畫特與中國醫藥大學合作,開設JEMBOSS基礎課程。JEMBOSS全名為Java-EMBOSS,即Java介面的EMBOSS程式圖形使用介面,為英國的HGMP-RC(Human Genome Mapping Program Resource Centre)所開發並持續維護更新,採用user-friendly的Java視窗執行EMBOSS程式,並加入檔案管理功能,使用者download Java we start執行程式後,即可在自己的PC操作JEMBOSS並儲存分析結果,使用方便。本課程將介紹網路資源、常用JEMBOSS軟體之原理和使用方法介紹,並提供電腦實作,讓使用者能更在課程結束後順利使用JEMBOSS進行序列分析的工作。本課程為最基礎之課程,適合初學序列分析者。

 

課程內容:

時間:95年 3月 24日 (星期五)

地點:中國醫藥大學 立夫教學大樓 5F 視聽電腦教室
   台中市學士路91號 [學校位置] ; [教室位置]

上課人數: 60人

報名費:免費

講 員 :國家衛生研究院 生醫資訊服務組 李桂玉 主任、、王旭川 女士

議程:

時   間
內    容
95 年 3 月24日
(星期五)
09:00 - 17:00
  • 課程簡介(李桂玉)
  • JEMBOSS系統簡介及基本操作 (汪詩海)
  • 資料庫及 EMBOSS 程式簡介:wossname, seqret (汪詩海)
  • 以文字搜尋資料庫Entrez, ExPASy, EBI (李桂玉)
  • 資料庫搜尋比對BLAST (李桂玉)
  • 序列比對分析基本概念 (李桂玉)
  • JEMBOSS序列分析程式簡介 needle, water, emma, showalign, prettyplot (李桂玉)
  • JEMBOSS序列分析程式簡介remap, getorf, plotorf (王旭川)

學員名單:

姓 名
機  構
職 稱
尹寶倫
彰化基督教醫院
研究助理
王信文
彰化師範大學
專任教師
王施勝
仁德醫專
助理教授
田淑麗
中華醫事學院
研究生
石雅惠
自然科學博物館
研究助理
何小曼
台北教育大學
教授
余秋潔
屏東科技大學
研究生
余養豪
中國醫藥大學
醫師
吳介信
中國醫藥大學
副教授
吳啟瑞
中國醫藥大學
助理教授
吳禮字
中國醫藥大學
副教授
周紹婷
屏東科技大學
研究生
林武周
中國醫藥大學
專任教師
林純慧
中華技術學院
研究生
林蕙俐
中國醫藥大學
研究生
邱一中
農委會農業試驗所
助理研究員
施兆蘭
中國醫藥大學
住院醫師
施維真
中國醫藥大學
專任助理
洪雅雯
中國醫藥大學
研究生
唐娜櫻
中國醫藥大學
副教授
張美瑜
中國醫藥大學
研究生
張容菱
屏東科技大學
研究助理
張淑貞
中國醫藥大學
副教授
張雅琁
中興大學
研究生
莊淑錚
台北教育大學
研究生
莊淨媛
中國醫藥大學
副教授
許正德
台中榮總
研究助理
郭淑明
中興大學
博士生
郭傑民
海洋生物博物館
助理研究員
陳信銨
台中教育大學
研究生
陳郁芬
中國醫藥大學
學生
陳雅萱
農業藥物毒物試驗所
研究助理
黃文哲
中興大學
副教授
黃淑玲
中華醫事學院
講師
黃瓊賢
中國醫藥大學
研究助理
溫証皓
中國醫藥大學
研究生
萬 磊
中國醫藥大學
助理教授
葉志清
中國醫藥大學
助理教授
廖秀英
農業藥物毒物試驗所
研究助理
廖純慧
中國醫藥大學
研究生
廖朝財
中台科技大學
副教授
劉以葭
台灣大學
學生
潘時玫
中興大學
博士生
蔡淑珍
龍鳳生化科技
專員
鄭秋玉
中華技術學院
研究助理
蕭茹萍
農業藥物毒物試驗所
專業助理
賴以祥
交通大學
博士生
賴宜伯
屏東科技大學
研究生
賴姿文
中國醫藥大學
研究生
謝文聰
中國醫藥大學
副教授
謝長奇
中國醫藥大學
助理教授
謝素娥
中台科技大學
副教授
謝耀文
朝陽科技大學
研究生
鍾麗君
弘光科技大學
研究生
簡宣裕
農委會農業試驗所
副研究員
魏長菁
中國醫藥大學
主治醫師
蘇冠賓
中國醫藥大學
醫師

報名方式及注意事項:

    1. 本課程以 E-mail 發給學員上課通知,報名資格請勿轉讓或代理參加。
    2. 請準時於早上 8:30-9:00 報到,請先至報到處領取講義,再逕行入座。
    3. 上課時可自行帶 DNA 序列做為練習之用,請以純文字格式存在磁碟片隨身碟中。
    4. 上課時請勿攜帶太多物品,並請遵守上課場所的相關規定。
    5. 本課程恕不供應午餐
    6. 本課程遵守中國醫藥大學規定,自行開車者,停車費用請參考中國醫藥大學網頁說明

洽詢方式:

國家衛生研究院 生醫資源中心 
電話:(037) 246166 轉 33621
傳真:(037) 586410
E-mail:service@tbi.org.tw
地址:350苗栗縣竹南鎮科研路35號