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Taiwan Bioinformatics Institute

台灣生物資訊組織(Taiwan Bioinformatics Institute)及轉譯醫學暨生技研發之生物資訊核心

台灣生物資訊組織(Taiwan Bioinformatics Institute，簡稱TBI)是結合國內生物資訊中心所組成，最初是由國家衛生研究院、國立清華大學、國立交通大學及國立成功大學等四所機構的生物資訊中心組成，後有中央研究院資訊研究所在2015年加入，亞洲大學資訊工程所於2021年加入。TBI透過設立核心設施來結合生物資訊社群的力量，提供快速便捷且完善的生物資訊服務，致力於健全台灣的生物資訊基礎建設，以及建立亞洲一流的生物資訊核心設施。

TBI所設置的「轉譯醫學暨生技研發之生物資訊核心」，前身是「TBI核心設施」及「基因體醫學暨生技研發之生物資訊核心設施」，乃是因應政府發展轉譯醫學的政策所設立，提供下列主題的生物資訊服務:

• 協調中心、功能基因體及轉譯醫學、癌症基因體學及臨床研究
• 結構蛋白質體學及藥物應用
• 轉錄體學及宏觀基因體學
• 應用基因體醫學
• 生醫文獻探勘及生物標記探索

我們的專業領域涵蓋範圍廣，子計畫以專業分工，開發新穎工具與資料庫，提供線上服務；「轉譯醫學暨生技研發之生物資訊核心」在協調中心的統籌下依使用者需求組成團隊，以客戶為中心(Client-centric)，透過與高通量實驗之核心和產業界合作，提供研究人員生物資訊各領域從研究設計、實驗轉介、資料前處理、資料分析到生物意義闡釋的一站式完整客製化資料分析服務，服務深入詳實，能滿足多樣的生物資訊需求。

我們將聚焦癌症與感染症研究，並開拓與產業界的合作，作為支援轉譯醫學及生技研發的主要策略，同時透過教育訓練引介前瞻技術，以培訓生物資訊人才。相信藉由本核心的努力，將可提升研發能量，促進生命科學與生技產業的整體發展。

提供基礎線上序列分析服務，同時負責核心設網站維護和諮詢服務，協調客製化資料分析服務，並統籌教育訓練課程及研討會的執行。任何問題均歡迎來電037-206166 轉33621,或email至service@tbi.org.tw。

 

提供以功能基因體及轉譯醫學為主軸所發展出的生物資訊工具，搭配"易學易懂易操作"的人性化使用介面，利用無遠弗屆的網路提供最便利迅速的服務，同時提供高通量比較基因體資料分析、微生物菌叢的多源基因體(metagenome)或轉錄體(metatranscriptome)分析、交互作用體分析、抗原決定部位分析、病毒基因體分析、病原體監測應用、代謝網路分析、藥物基因體學資料分析等客製化服務。

 

提供結構生物資訊分析工具及資料庫之網路服務，針對下一階段的基因體醫學領域，如癌症研究，傳染病，高度遺傳疾病以及新藥研發等重點進行結構生物資訊工具的研究與開發，並將研發成果建置為線上服務。此外，並建有全球最完整的micro RNA 資料庫miRTarBase，提供高通量micro RNA資料分析客製化服務，化合物與蛋白質結構整合性分析之藥物設計，以及宏觀基因體分析客製化服務。

 

利用統計分析方法的研究改進，以及應用公用軟體與資料庫(例如1000 genome project, ENCODE, TCGA (The Cancer Genome Atlas)提供在癌症基因體之高通量數據處理之各面向提供客製化整合性服務，以及利用Biomarker建立Risk prediction model之服務。

 

發展並維護不同種類生物資訊資料庫及加值型資料庫來支援科學界及醫學界的研究，利用生物資訊學的理論及方法來發展研究分析工具以解決基因體醫學的問題，開發分析工具與資料庫，並提供應用高通量技術的資料分析客製化服務。包括:

1. 利用NGS 數據來幫助尋找與疾病相關之基因或序列變異。
2. 利用整合不同類型的”omics”資料，發展新的生物資訊分析方法，應用於癌症、感染症及遺傳疾病等深入研究。
3. 建立合作策略夥伴，成為南台灣生物資訊研究與服務中心。
4. 建立南部教育訓練中心進行教育推廣。

 

建立及維護蛋白質重要之資料庫在台灣的鏡像站，蛋白質結構分析、比對及藥物設計軟體外，亦廣泛應用已開發之結構生物資訊分析工具，協助研究者探討生物分子結構與功能的關係，並進一步應用於藥物醫學的研究，同時提供蛋白質結構資料分析客製化服務及客製化課程。

 

提供生醫文獻探勘服務(Biomedical Text Mining)以及以質譜為基礎的代謝體定量和定性服務 (MS-based metabolomics quantitation and identification)。我們的文獻探勘服務結合了InfoMap分析工具以及natural language agent，建構 Question Answering系統，進行文獻蒐集與排序、專有名詞辨識與鏈結及名詞關聯擷取，從生命科學文獻中搜尋到基因體及蛋白質體關聯的知識。以質譜為基礎的代謝體定量和定性服務 (MS-based metabolomics quantitation and identification)則包括代謝體在質譜儀測得各波峰的量(abundance)，同位素比(isotope ratio)，及其價數(charge state)之定量分析，以及以峰值(peak)做群組(grouping)及標記(annotation)的定性分析。