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基因體醫學生技研發生物資訊核心

JEMBOSS 基 礎 課 程

 

主辦單位:

國家衛生研究院
中央研究院生命科學圖書館
基因體醫學國家型科技計畫

※ 學員名單

簡介:

基因體醫學生技研發生物資訊核心為基因體醫學國家型科技計畫所支持,以提供並推廣各項生物資訊服務為宗旨。為普及 JEMBOSS 分析工具的使用,本計畫特與中央研究院生命科學圖書館合作,開設 JEMBOSS 基礎課程。JEMBOSS 全名為 Java-EMBOSS,即 Java 介面的 EMBOSS 程式圖形使用介面,為英國的 HGMP-RC (Human Genome Mapping Program Resource Centre) 所開發之軟體,採用 user-friendly 的 Java 視窗執行 EMBOSS 程式,並加入檔案管理功能,使用者於下載並且安裝 Java we start 程式後, 即可在自己的 PC 上操作 JEMBOSS,進行序列分析工作並儲存結果,使用相當方便。本課程將介紹 JEMBOSS 分析工具之原理和操作方法,並透過電腦實作的方式,讓使用者能在課程結束後順利使用 JEMBOSS 並進行序列分析的工作。本課程為最基礎之課程,適合序列分析初學者報名參加

課程內容:

時間:97 年 10月 30-31 日 (星期四、星期五)

地點:中研院生命科學圖書館電腦教室
   台北市南港區研究院路二段 128 號  [地圖]

上課人數: 50人

報名費:免費

講 員 :國家衛生研究院 生醫資訊服務組 汪詩海 先生、王旭川 女士

議程:

時   間
內    容
97 年 10 月30日
(星期四)

09:30 - 16:30

  • 課程簡介(汪詩海)
  • JEMBOSS系統簡介及基本操作 (汪詩海)
  • 資料庫及 EMBOSS 程式簡介:wossname, seqret (汪詩海)
  • 以文字搜尋資料庫Entrez, ExPASy, EBI (汪詩海)
  • 序列比對分析基本概念 (王旭川)
  • 資料庫搜尋比對BLAST (王旭川)
  • JEMBOSS序列分析程式簡介 needle, water, emma, showalign, prettyplot (王旭川)
  • JEMBOSS序列分析程式簡介remap, getorf, plotorf (汪詩海)
  • 97 年 10 月31日
    (星期五)

    09:30 - 12:00

  • JEMBOSS引子預測程式 primer3 (王旭川)
  • JEMBOSS蛋白質特性分析程式 pepstats, charge, hmoment, pepwheel (王旭川)
  • JEMBOSS蛋白質pattern搜尋:patmatmotifs, fuzzpro (汪詩海)
  • EMBOSS GUI 介紹 (汪詩海)
  • 學員名單:

    姓 名
    單  位
    職 稱
    ROBERT LEE
    LI MINS CO., LTD.
    MGR.
    王律棚
    東華大學
    研究生
    吳美萱
    中央研究院
    學生
    吳淩巧
    台灣大學
    研究生
    李啟鳴
    中國文化大學
    學生
    林威儀
    中興大學
    學生
    連紹甫
    中國文化大學
    學生
    陳兆群
    中國醫藥大學
    博士後研究
    陳怡璇
    台灣大學
    研究生
    陳信宇
    成功大學
    研究生
    黃建富
    義守大學
    助理教授
    劉 蓉
    台灣大學
    研究生
    鄧華真
    疾病管制局
    副研究員
    鍾建邦
    東吳大學
    博士生
    簡淑婉
    疾病管制局
    助理研究員
    譚家凱
    疾病管制局
    研究助理
    蘇信芳
    國家衛生研究院
    博士班研究生

     

    報名方式及注意事項:

    1. 本課程以 E-mail 發給學員上課通知,報名資格請勿轉讓或代理參加。
    2. 請準時於 10/30 上午 9:00-9:30 之間報到,報到時將發給上課證供進出圖書館之用,請先出示上課證,待館員開門後進入,注意勿逕用手推閘門,以免閘門損壞
    3. 上課時可自行帶 DNA/Protein 序列做為練習之用,建議以 "純文字格式" 存在隨身碟中。
    4. 進入教室前請將背包放入生圖櫃臺前之置物箱,並請遵守上課場所的相關規定。
    5. 本課程恕不供應午餐
    6. 本課程遵守中研院規定,恕不提供免費停車。自行開車者,停車費用請參考中研院網頁說明

    洽詢方式:

    國家衛生研究院 生醫資訊組 汪詩海 先生
    電話:(037) 246166 轉 33629
    傳真:(037) 586410
    E-mail:service@tbi.org.tw
    地址:350苗栗縣竹南鎮科研路35號

     

     
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